北海道函馆的斧江财阀收到了一封来自怪盗基德的预告信。这次,基德似乎对一把幕末时代新选组副长土方岁三所持的日本刀情有独钟。一直以珍贵宝石为目标的基德,为何突然对刀剑产生了兴趣? 与此同时,西部的名侦探服部平次与柯南一行人,也因即将在函馆举行的剑道大会而来到了这座城市。在怪盗预告的当天,平次凭借敏锐的洞察力识破了基德的伪装,将其逼入绝境,但却意外地发现,基德的面貌酷似工藤新一?这让原本知晓柯南真身的平次陷入了困惑…… 在函馆的仓库区,人们发现了一具身上有十字形伤痕的尸体。调查中,一个被称为“死亡商人”的日裔美国男子浮出水面,他以武器贩子的身份在亚洲活动。他正在寻找斧江家族初代家主在函馆某处隐藏的宝物,据说这宝物与战时的军需产业紧密相关,拥有改变当时日本战局的力量。传言中,这件宝物与基德所觊觎的刀剑有着不解之缘。为了对抗以刀为目标的基德,一位神秘的剑士正悄然逼近…… 刀中隐藏的“真相”,如同破晓前的曙光,被引导至月光之下—— 一场围绕至宝的激烈争夺与推理之战,即将在此地上演!